L’école Saint-François-d’Assise peut compter sur la collaboration de nombreux partenaires. Tous ces partenaires contribuent à un titre ou un autre au succès de la mission de l’école :
- Académie Dunton
- Allô prof
- Bibliothèque Mercier
- CLSC de Pointe-aux-Trembles-Montréal-Est
- Clubs des petits déjeuners du Québec
- CSSS de la Pointe-de-l’Île
- École Édouard-Montpetit
- École Louise-Trichet
- L’école et les arts
- La Maison des enfants
- Les Services d’accueil, de référence, de conseil et d’accompagnement (SARCA)
- Loisirs Longue-Pointe
- Maison de la culture Mercier
- Maison des familles de Mercier-Est
- Réseau réussite Montréal
- Service de police de la Ville de Montréal – Poste de quartier 48
- Tel-jeunes
- Une école montréalaise pour tous